Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms