Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Mms19Q9D071 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Mms19Q9D071 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Mms19Q9D071 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Mms19Q9D071 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Mms19Q9D071 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Mms19Q9D071 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mms19Q9D071 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Mms19Q9D071 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Mms19Q9D071 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Mms19Q9D071 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mms19Q9D071 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mms19Q9D071 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Mms19Q9D071 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mms19Q9D071 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Mms19Q9D071 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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