Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms