Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms