Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx7Q9CY18 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms