Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms