Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms