Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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