Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms