Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccer1Q9CQL2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ccer1Q9CQL2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccer1Q9CQL2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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