Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms