Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Chmp3Q9CQ10 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Chmp3Q9CQ10 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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