Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

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Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Nsmce3Q9CPR8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms