Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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