Protein–RNA interactions for Protein: Q99P87

Retn, Resistin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetnQ99P87 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
RetnQ99P87 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms