Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms