Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms