Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a4dQ99N05 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Higd1a-202ENSMUST00000213124 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms