Protein–RNA interactions for Protein: Q99M71

Epdr1, Mammalian ependymin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epdr1Q99M71 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms