Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Sh3bp5lQ99LH9 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Sh3bp5lQ99LH9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Sh3bp5lQ99LH9 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Sh3bp5lQ99LH9 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Sh3bp5lQ99LH9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Sh3bp5lQ99LH9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Sh3bp5lQ99LH9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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