Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms