Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Rnf144aQ925F3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Rnf144aQ925F3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Rnf144aQ925F3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Rnf144aQ925F3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Rnf144aQ925F3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Rnf144aQ925F3 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Rnf144aQ925F3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rnf144aQ925F3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rnf144aQ925F3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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