Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms