Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Klhdc3Q8VEM9 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Klhdc3Q8VEM9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms