Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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