Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms