Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms