Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms