Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Abcf3Q8K268 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Abcf3Q8K268 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Abcf3Q8K268 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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