Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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