Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Znf628Q8CJ78 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Znf628Q8CJ78 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Znf628Q8CJ78 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Znf628Q8CJ78 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Znf628Q8CJ78 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Znf628Q8CJ78 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Znf628Q8CJ78 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Znf628Q8CJ78 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Znf628Q8CJ78 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Znf628Q8CJ78 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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