Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ccdc17Q8CE13 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ccdc17Q8CE13 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ccdc17Q8CE13 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ccdc17Q8CE13 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ccdc17Q8CE13 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ccdc17Q8CE13 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ccdc17Q8CE13 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ccdc17Q8CE13 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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