Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Atg4aQ8C9S8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Atg4aQ8C9S8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Atg4aQ8C9S8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Atg4aQ8C9S8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Atg4aQ8C9S8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Atg4aQ8C9S8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Atg4aQ8C9S8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Atg4aQ8C9S8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Atg4aQ8C9S8 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Atg4aQ8C9S8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Atg4aQ8C9S8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Atg4aQ8C9S8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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