Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Atg16l1Q8C0J2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Atg16l1Q8C0J2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms