Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF3

Me3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me3Q8BMF3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Me3Q8BMF3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Me3Q8BMF3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Me3Q8BMF3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms