Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKS9

Pum3, Pumilio homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum3Q8BKS9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pum3Q8BKS9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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