Protein–RNA interactions for Protein: Q810Q5

Nmes1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmes1Q810Q5 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmes1Q810Q5 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Nmes1Q810Q5 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nmes1Q810Q5 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nmes1Q810Q5 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nmes1Q810Q5 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nmes1Q810Q5 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nmes1Q810Q5 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nmes1Q810Q5 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nmes1Q810Q5 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nmes1Q810Q5 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nmes1Q810Q5 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nmes1Q810Q5 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nmes1Q810Q5 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms