Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Smim19Q80ZU4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Smim19Q80ZU4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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