Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Amigo1Q80ZD8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms