Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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NanogQ80Z64 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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NanogQ80Z64 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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NanogQ80Z64 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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NanogQ80Z64 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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NanogQ80Z64 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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NanogQ80Z64 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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NanogQ80Z64 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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NanogQ80Z64 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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NanogQ80Z64 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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NanogQ80Z64 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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NanogQ80Z64 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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