Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcsk9Q80W65 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms