Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ell3Q80VR2 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms