Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms