Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms