Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms