Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms