Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms