Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms