Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms