Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smchd1Q6P5D8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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